こちらでもさくらサーバーで同様な症状が出て困ったことがあります。

（最終的に解決に至ってはいませんが、参考情報として記します。ちなみに、私はhaikで、根本的にQHMでも同様と思われます）

これはまさに特定ページでしか発生せず、内容としては全く何の変哲も無い画像を交えているだけで外部リンクは数件といったもの。書き始めの保存では何の問題もなく、ある分量に達してから突然保存に時間がかかる（最終的に保存できていない）というものです。（内容文字数にしてせいぜい1000文字程度）

これはどうもサーバー側のプログラムがループしている感じがしました。そこで保存できずに立ち往生している時、さくらサーバーにログインしてみたところ、CPUが100%動作となっていることがわかりました。これはサーバー上のPHPプログラムが正常に働いていないということです。

これを放置していると、一定時間で強制終了させられますが、他のユーザーに迷惑かもと思い、こちらの操作でプロセスを終了させるという操作を行いました。

この件を北研に問い合わせたことがあるのですが、原因不明で解決に至らずです。（ま、深い入りしても仕方ないと思い、サーバー側でのエラーログも取らずです）

そこで、保存してエラーが出るページのテキストの内容だけコピーして別に保存しておき、該当ページを一旦削除してから新たにページを作り直し、用心しながら編集保存してやり過ごしています。

ちなみに、システムの修復、アクセス権の確認などしても解決しません。