初めまして、エガシラと申します。少し困っておりますので、ご教授いただければ幸いです。
haikの最新バージョンを使用しております。

QBlogを使用しております。そのブログカテゴリリストに「ブログ(1)」というものがいつの間にか現れていました。（#qblog_categoryで表示しています）

その記事内容を見ますと、何かトップページのようなものが記事として書かれています。

寝ぼけて何か間違ったかな？と、その記事を消去したところ、ブログ記事全体が表示されなくなりました。慌ててバックアップから復元しました。

本当に何がなんだか分かりません…

文章では分かりづらいと思いますが、対策方法がわかる方、ご教授いただければ助かります。よろしくお願いします。

http://pc.dk-as.com/

他に回答される方がいないということは、解決は困難なのかもしれません。
最新版ということですが6.0．4でしょうか。
7.0．0betaも試してみると良いかもしれません。

一案として、
該当の記事を編集で、カテゴリを「エラーページ」など、適当な物に変えてよけておくということはできるでしょうか。
通常のブログ記事であれば、編集でカテゴリ変更できるはずです。
カテゴリを変えた後は、
そのページの記事を削除するとブログトップページが消えるということなので、記事の内容も、1文字、あるいは白紙コメントだけ残して白ページとして残してみるのはどうでしょうか。
このページをいじると全体がおかしくなるなら、触れないですね。
これらの実験前にバックアップを取っておくのは必要でしょう。

> 慌ててバックアップから復元しました。

復元したと言うことは、現在は直っているのでしょうか？

> その記事を消去したところ、ブログ記事全体が表示されなくなりました。

ブログ記事全体が消える現象で、よくある間違え操作の例ですが、
ブログ一覧ページ内にあるプラグイン #qblog_list を削除するケースが
考えられます。従って、その復活には #qblog_list の一行を追加して
あげれば元に戻ります。

HP拝見しました。
カテゴリー変更はできましたね。
あとはこのページの文章を少しずつ消して、プレビューで確認しながら、白紙ページにできるかやってみたらどうかと思います。プレビューだけなら、更新しない限りそのページは変更されませんから。試してみる価値はあると思います。
　どこでエラーが出るのかわかるかもしれません。最終的に、ページ削除は無理でも、白紙ページにはできるかもしれません。

少し詳細に観察してみました。
カテゴリ「エラーページです」にあるサムネイルはFrontPageになっていますね。
「エラーページです」に出ているサムネイルの記事を削除するとFrontPageも削除されるのでしょうか？
　もし削除されてしまうなら、何らかの理由でFrontPageがブログに登録されてしまっている状態と思われます。削除されないならFrontPageのコピーがブログに登録されているということかもしれません。

うみほし様

ご丁寧なアドバイスをありがとうございます。
またお返事が遅くなり申し訳ありません。

>>「エラーページです」に出ているサムネイルの記事を削除するとFrontPageも削除されるのでしょうか？

この記事を削除しますと、なぜかブログ全体がおかしくなります。トップページは消えません。
ですので、実験でブログ記事内容を「エラーページです　ブログトップへお戻りください」と書いて更新しましたら、やはりブログ全体がおかしくなってしまいました‥速攻でバックアップから復元しました。

せめてこのカテゴリを一番下に持って行きたくて、「20 エラーページ」などとしてみましたが、一番上に固定されるみたいです‥

>>最新版ということですが6.0．4でしょうか。
>>7.0．0betaも試してみると良いかもしれません。
6.04です。7.0betaがあるんですね？まだチラッとしか探していませんが、やり方が分かりません。頑張って試してみます！！

ご指導アドバイスありがとうございます！！

効果があるか分かりませんが、「システムの修復」を試みてはどうでしょうか。
また、お使いのサーバーのPHPのバージョンは5.3〜5.6になっているでしょうか。